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๋ถ„๋ฅ˜ ์ „์ฒด๋ณด๊ธฐ 128

[Deep Learning] CNN์˜ ๊ฐœ๋…, Object Detection

๋”ฅ๋Ÿฌ๋‹ ๋ชจ๋ธ ์ค‘ ํ•˜๋‚˜์ธ CNN(Convolutional Neural Network)์— ๋Œ€ํ•ด ์•Œ์•„๋ณด์ž. CNN์€ computer vision problem์—์„œ ๋งŽ์ด ์“ฐ์ธ๋‹ค. ํŠนํžˆ ๊ทธ ์ค‘ ๋งŽ์ด ํ™œ์šฉ๋˜๋Š” ๊ฒƒ์€ object detection์ด๋‹ค. Object Detection์ด๋ž€? Feature extraction(ํŠน์ง• ์ถ”์ถœ) ์ด๋ฏธ์ง€์—์„œ ๋Œ์–ด๋‚ผ ์ˆ˜ ์žˆ๋Š” ์œ ์šฉํ•œ feature ์ถ”์ถœ Bounding Box ์ƒ์„ฑ object๋ฅผ ๊ฐ์‹ธ๋Š” bounding box ์ƒ์„ฑ Class classification bounding box ์•ˆ์˜ object๊ฐ€ ์–ด๋–ค class์ธ์ง€ ๋ถ„๋ฅ˜ํ•˜๋Š” ๊ณผ์ • CNN(Convolutional Neural Network) image์˜ ํ˜•ํƒœ๋ฅผ ๋ณด์กดํ•˜๋„๋ก ํ–‰๋ ฌ ํ˜•ํƒœ์˜ ๋ฐ์ดํ„ฐ๋ฅผ ์ž…๋ ฅ๋ฐ›์•„ ์ •๋ณด ์†์‹ค์„ ๋ฐฉ์ง€ํ•˜๊ณ ,..

[Machine Learning] ๋จธ์‹ ๋Ÿฌ๋‹ workflow, ๋ฐ์ดํ„ฐ์…‹ ๋ถ„๋ฆฌ

ahnty0122.tistory.com/58 [Deep Learning] ๋”ฅ๋Ÿฌ๋‹/๋จธ์‹ ๋Ÿฌ๋‹/์ธ๊ณต์ง€๋Šฅ์˜ ์ฐจ์ด, ์ธ๊ณต์‹ ๊ฒฝ๋ง ๊ฐœ๋… ๋”ฅ๋Ÿฌ๋‹์— ๋Œ€ํ•ด ์ดํ•ดํ•˜๋ ค๋ฉด ๋จผ์ € ์ธ๊ณต์ง€๋Šฅ, ๋จธ์‹ ๋Ÿฌ๋‹, ๋”ฅ๋Ÿฌ๋‹์˜ ์ฐจ์ด์ ์„ ์•Œ์•„์•ผํ•œ๋‹ค. ์ธ๊ณต์ง€๋Šฅ(AI): ์‚ฌ๋žŒ์˜ ์ง€๋Šฅ์„ ๋ชจ๋ฐฉํ•ด ์‚ฌ๋žŒ์ด ํ•˜๋Š” ๋ณต์žกํ•œ ์ผ์„ ํ•  ์ˆ˜ ์žˆ๋Š” ๊ธฐ๊ณ„๋ฅผ ๋งŒ๋“œ๋Š” ๊ฒƒ ๋จธ์‹ ๋Ÿฌ๋‹(ML): ์ž… ahnty0122.tistory.com Machine Learning Workflow ์œ„์˜ ๊ธ€์—์„œ ์ธ๊ณต์‹ ๊ฒฝ๋ง์„ ํ•™์Šตํ•˜๋Š” ๊ณผ์ •์— ๋Œ€ํ•ด ์ ์–ด๋†จ๋Š”๋ฐ, ์ด ์ธ๊ณต์‹ ๊ฒฝ๋ง์„ ํ•™์Šตํ•˜๋Š” ๋ฐฉ๋ฒ•์— ๋Œ€ํ•ด ์•Œ์•„๋ณด์ž. ๋ฏธ๋ฆฌ ์ •ํ•ด์ง„, ๋‹ต์ด ์žˆ๋Š” ํŠธ๋ ˆ์ด๋‹ ๋ฐ์ดํ„ฐ๋กœ ๋จธ์‹ ๋Ÿฌ๋‹ ์•Œ๊ณ ๋ฆฌ์ฆ˜์„ ํ•™์Šตํ•ด ๋ชจ๋ธ์„ ์–ป๋Š” training(ํ•™์Šต)๊ณผ์ •์„ ๊ฑฐ์ณ ์˜ฌ๋ฐ”๋ฅด๊ฒŒ ํ•™์Šต์ด ๋˜๋Š”์ง€ ์ž„์˜์˜ ์ž…๋ ฅ๋ฐ์ดํ„ฐ๋ฅผ ํ†ตํ•ด ๊ฒฐ๊ณผ๋ฅผ ํ™•์ธํ•˜๋Š” test ๊ณผ์ •์„ ..

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[๊ฐœ๋ฐœ ํ™˜๊ฒฝ] ์œˆ๋„์šฐ์— CUDA ๋ฒ„์ „์— ๋งž๊ฒŒ torch ์„ค์น˜, pytorch GPU ์‚ฌ์šฉ

ahnty0122.tistory.com/37?category=454641 [ํ™˜๊ฒฝ์„ค์ •] ์œˆ๋„์šฐ(Windows)์— Tensorflow-gpu ์„ค์น˜(NVIDIA driver, CUDA Toolkit, cuDNN ์„ค์น˜) GPU๋ฅผ ์ด์šฉํ•ด ๋ชจ๋ธ์„ ํ•™์Šต์‹œํ‚ค๋ฉด ํ•™์Šต ์†๋„๊ฐ€ ๋งค์šฐ๋งค์šฐ๋งค์šฐ ๋น ๋ฅด๋‹ค. ๊ทธ๋ž˜์„œ ๋”ฅ๋Ÿฌ๋‹์€ ๋ชจ๋ธ GPU๊ฐ€ ์—†์œผ๋ฉด ํ•™์Šต์‹œํ‚ค๊ธฐ ์–ด๋ ค์›€. ๊ทผ๋ฐ ์ฒ˜์Œ ๋”ฅ๋Ÿฌ๋‹ ๋ชจ๋ธ ๋Œ๋ฆด ๋•Œ ๋‚˜๋ฅผ ์ •๋ง ์• ๋จน์ด๋˜..^^ tensorflow-gpu ์„ค ahnty0122.tistory.com ์•ž์„  ๊ธ€์— ์ ์–ด๋†“์•˜๋˜ nvidia driver ์„ค์น˜, cuda ์„ค์น˜, cudnn ์„ค์น˜๋ฅผ ์™„๋ฃŒํ•œ ํ›„ ์ง„ํ–‰ํ•˜๋ฉด torch ์„ค์น˜๋Š” ์•„์ฃผ ์‰ฝ๋‹ค. ์šฐ์„  cmd ์ผœ์„œ cuda ๋ฒ„์ „ ํ™•์ธ nvcc --version cuda๊ฐ€ 10.0์ด๋ฏ€๋กœ ๊ทธ์— ๋งž๋Š” torc..

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[MySQL] ๋‚ด์žฅํ•จ์ˆ˜ - ์ˆ˜ํ•™ ํ•จ์ˆ˜, ๋‚ ์งœ/์‹œ๊ฐ„ ํ•จ์ˆ˜, ์‹œ์Šคํ…œ/์ •๋ณด ํ•จ์ˆ˜

์ˆ˜ํ•™ ํ•จ์ˆ˜ ABS(์ˆซ์ž) : ์ ˆ๋Œ€๊ฐ’ ๊ณ„์‚ฐ CEILING(์ˆซ์ž) : ์˜ฌ๋ฆผ FLOOR(์ˆซ์ž) : ๋‚ด๋ฆผ ROUNG(์ˆซ์ž) : ๋ฐ˜์˜ฌ๋ฆผ CONV(์ˆซ์ž, ๊ธฐ์กด ์ง„์ˆ˜, ๋ฐ”๊ฟ€ ์ง„์ˆ˜) : ๊ธฐ์กด ์ง„์ˆ˜์—์„œ ๋‹ค๋ฅธ ์ง„์ˆ˜๋กœ ๋ฐ”๊ฟ”์ฃผ๋Š” ํ•จ์ˆ˜ SELECT ABS(-100); SELECT CEILING(4.7), FLOOR(4.7), ROUND(4.7); SELECT CONV('AA',16,2), CONV(100,10,8); -- 16์ง„์ˆ˜ AA๋ฅผ 2์ง„์ˆ˜๋กœ ๋ณ€๊ฒฝ, 10์ง„์ˆ˜์˜ 100์„ 8์ง„์ˆ˜๋กœ ๋ณ€๊ฒฝ MOD(์ˆซ์ž1, ์ˆซ์ž2), ์ˆซ์ž1 % ์ˆซ์ž2 : ์ˆซ์ž1์„ ์ˆซ์ž2๋กœ ๋‚˜๋ˆˆ ๋‚˜๋จธ์ง€ ๋ฐ˜ํ™˜ POW(์ˆซ์ž1, ์ˆซ์ž2) : ์ˆซ์ž1์„ ์ˆซ์ž2๋งŒํผ ๊ฑฐ๋“ญ์ œ๊ณฑํ•œ ๊ฐ’ ๋ฐ˜ํ™˜ SQRT(์ˆซ์ž) : ์ˆซ์ž์˜ ์ œ๊ณฑ๊ทผ ๋ฐ˜ํ™˜ select mod(228, 10), 228%10, ..

DB(Database)/MySQL 2021.02.06

siRNA, RNAi, off-target effect

RNAi(RNA interference) siRNA(short interfering RNA)๋ผ ๋ถˆ๋ฆฌ๋Š” 12~21 mer์˜ dsRNA์— ์˜ํ•ด ์„œ์—ด ํŠน์ด์ ์œผ๋กœ ์œ ์ „์ž ๋ฐœํ˜„์ด ์–ต์ œ๋˜๋Š” ํ˜„์ƒ --> RNA ๊ฐ„์„ญ gene silencing by RNAi RNA ๊ฐ„์„ญ์„ ์ด์šฉํ•ด ํŠน์ • ์œ ์ „์ž์˜ ํ™œ์„ฑ์„ ์–ต์ œํ•  ์ˆ˜ ์žˆ์Œ ํ‘œ์  mRNA์™€ ์ƒ๋ณด์  ๊ด€๊ณ„์— ์žˆ๋Š” ์ด์ค‘๊ฐ€๋‹ฅ RNA ๋ฅผ ์„ธํฌ์— ๋„์ž…ํ•˜๋Š” ๋ฐฉ๋ฒ•์œผ๋กœ ์–ต์ œ ๊ฐ€๋Šฅ ๋‹จ์ : ํšจ๊ณผ๊ฐ€ ์ผ์‹œ์ ์ผ ์ˆ˜ ์žˆ์œผ๋ฉฐ, ๋‹ค๋ฅธ ์œ ์ „์ž ๋ฐœํ˜„๋„ ์–ต์ œํ•  ์ˆ˜ ์žˆ์Œ siRNA(short interfering RNA) off-target effect ์ค„์—ฌ์„œ design ํ•ด์•ผํ•จ Off-target effect siRNA๋ฅผ ์ด์šฉํ•œ RNAi์˜ ๋ถ€์ž‘์šฉ, ๋‹ค๋ฅธ ์œ ์ „์ž ๋ฐœํ˜„๋„ ์–ต์ œ๋˜๋Š” ํ˜„์ƒ https://www.ibri..

Bioinfomatics 2021.02.03
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