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pandas 파일 불러오기 - csv 형식 파일 불러오기 import pandas as pd df = pd.read_csv('파일명.csv') # csv파일형식은 간단하게 불러와짐 - 탭으로 분리된 txt 파일 불러오기 import pandas as pd df= pd.read_csv('파일명.txt', delimiter = '\t') # 탭으로 분리된 txt(tsv 형식도 가능) 불러오기 - 공백으로 분리된 파일 불러오기 import pandas as pd df = pd.read_csv(‘파일명.확장자’, delimiter = ' ') # 공백으로 분리된 파일 불러오기 Dataframe의 data 개수 세기 print(len(df.index)) print(df.shape[0]) print(len(df))..

PostgreSQL 서버에 접속하기 psycopg2 설치 import psycopg2 conn_string = "host = 'localhost' dbname = 'db명' user = 'user명' password = '패스워드'" conn = psycopg2.connect(conn_string) cur = conn.cursor() 위의 코드 실행 후 SQL 쿼리를 파이썬으로 실행 가능 import pandas as pd cur.execute("쿼리문") # 예시 # cur.execute("SELECT * FROM [DB명];") result = cur.fetchall() # result에 결과 저장 # 쿼리문 실행 결과를 pandas dataframe 형식으로 만들기 my_df = pd.DataFra..

sql을 이용한 데베관리 시 csv나 다른 파일 형식으로 export/import 를 할 수 있다는 게 가장 편리함 저장하고 싶은 schemas table 선택 후 Tools -> Import/Export 선택 export 후 파일 이름 .csv로 바꾸면 csv로 저장됨

대용량 데이터베이스의 경우 덤프 파일로 저장되어 있는 경우 많음. 내가 사용했던 STRING Biological Pathway database의 경우 덤프파일의 크기도 83GB 라 상당히 컸음... 아무튼 이 명령 하나면 대용량 DB 덤프파일 복원 가능하다. 하지만 은근 시간 걸린다는점 ㅎㅅㅎ cmd 창 열고 입력 psql -U {유저네임} -d {덤프파일 풀고 싶은 DB명} -a -f {덤프파일위치} EX) psql -U postgres -d [mydbname] -a -f C:\Users\Downloads\[파일명].sql

DBMS(DataBase Management System) 중 하나 데이터베이스를 관리, 운영하는 소프트웨어 사용자나 응용 프로그램 --> DBMS가 관리하는 데이터에 동시에 접속하여 데이터를 공유함 https://www.postgresql.org/download/windows/ PostgreSQL: Windows installers Windows installers Interactive installer by EDB Download the installer certified by EDB for all supported PostgreSQL versions. This installer includes the PostgreSQL server, pgAdmin; a graphical tool for managi..

리눅스를 자주 사용하는데도 계속 기억이 안 날 때 보기 위한 정리~!~! 아는 거 생길 때마다 추가하기... vi 편집기 명령어 gg # 파일 맨 아래 보기 G # 파일 맨 위 보기 :q! # 파일 변경 사항 있을 때 저장 안 하고 나가기 :q # 파일 변경 사항 없음, 그냥 파일 나가기 :wq! # 파일 변경 사항 저장하며 나가기 :숫자 # 숫자 위치에 해당하는 열으로 이동 /검색 # /이후 단어 치면 검색 가능, /단어 검색 후 n 누르면 다음 단어로 이동 ls # 현재 목록 보기 ls [option] [directory/File] ls -l : 자세히 출력 mkdir # 디렉토리 생성 명령어 chmod # 권한 관리 chmod [options] mode[,mode] file1 [[file2 ...]..

Putty나 Ubuntu(우분투) 같은 서버 접속 툴인데 더 예쁘당 (코딩할 땐 예뻐야 할 맛 나죠?) mobaxterm.mobatek.net/download.html MobaXterm free Xserver and tabbed SSH client for Windows The ultimate toolbox for remote computing - includes X server, enhanced SSH client and much more! mobaxterm.mobatek.net 무료인 Home edition 다운받기~ mobaxterm은 여러 창을 한꺼번에 띄워서 여러 코드를 한꺼번에 실행시킬 수 있고, 다양하게 사용할 수 있다. 귀여운건 오래동안 아무 움직임 없으면 linux 펭귄 나온다 ㅋㅋㅋㅋ 귀..

리눅스 기반 터미널에서는 pwd 명령어로 현재 path 볼 수 있다. Anaconda prompt나 윈도우 cmd에서 path 보는 명령어 SET var = %cd% ECHO %var% 변수에 cd 저장 후 echo 명령어로 보기 간 -- 단 !